自2012年以来，我校本着“保证质量，适度发展”的总体原则，积极稳妥地推进来华留学本科临床医学专业教育。目前，在校生总人数173人，本科生170人（其中日照校区109人），研究生3人。毕业本科留学生82人，毕业留学研究生6人。全部为学历生。
留学本科生目前分布在济宁和日照两个校区。前3年在日照校区进行汉语、通识教育和基础医学课程的教育教学，后3年在济宁医学院附属医院进行临床医学课程的教学及临床见习、实习。留学生研究生全部在济宁进行教育培养。按照2017年教育部、外交部和公安部《42号令》要求，2018年起执行6年制临床医学本科教育，培养方案和课程设置相应调整。
留学生生源主要来自巴基斯坦、赞比亚、加纳、埃及、苏丹、坦桑尼亚等16个国家。2016年起新增英国、爱尔兰等发达国家少数生源。学历层次为本科生和研究生两个层次。
1名学校领导分管留学生教育工作。国际教育学院（外国语学院）设党总支书记1名，院长1名，副院长3名，其中分管留学生工作的副院长1名；设留学生管理科，科长（辅导员）1名，班主任3名；留学生教育科，副科长1名；附属医院设留学生教育管理办公室，主任1名。
成立了济宁医学院留学生教育与管理委员会，制定了《济宁医学院留学生教育与管理委员会章程》，负责留学生教育工作重大事项的商议和协调。树立“学生为本，安全第一，人性化、法制化并重”的管理理念，完善留学生管理制度，制定了《济宁医学院留学生管理规定》《济宁医学院留学生奖励条例》《济宁医学院留学生学士学位授予工作实施办法》《济宁医学院来华留学生突发事件应急处理预案》等一系列规章制度。